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2022-03-03
摘要翻译:
本文致力于基因组学中p-adic模型的基础。我们把核苷酸、密码子、DNA和RNA序列、氨基酸和蛋白质等作为信息系统,建立了相应的p-adic形式化的研究方法。每一个系统都有其特征素数,用来构造相关的信息空间。通过一些实例说明了这种方法的相关性。特别指出遗传密码的退化是一种p-adic现象。我们还提出了一个关于遗传密码进化的假设,假设原始密码是基于单核苷酸和时间顺序上的前四个氨基酸。这种p-adic基因组信息系统的形式可以在计算机程序中实现,并应用于各种具体情况。
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英文标题:
《p-Adic Modelling of the Genome and the Genetic Code》
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作者:
Branko Dragovich and Alexandra Dragovich
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最新提交年份:
2007
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分类信息:

一级分类:Quantitative Biology        数量生物学
二级分类:Other Quantitative Biology        其他定量生物学
分类描述:Work in quantitative biology that does not fit into the other q-bio classifications
不适合其他q-bio分类的定量生物学工作
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一级分类:Computer Science        计算机科学
二级分类:Information Theory        信息论
分类描述:Covers theoretical and experimental aspects of information theory and coding. Includes material in ACM Subject Class E.4 and intersects with H.1.1.
涵盖信息论和编码的理论和实验方面。包括ACM学科类E.4中的材料,并与H.1.1有交集。
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一级分类:Mathematics        数学
二级分类:Information Theory        信息论
分类描述:math.IT is an alias for cs.IT. Covers theoretical and experimental aspects of information theory and coding.
它是cs.it的别名。涵盖信息论和编码的理论和实验方面。
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一级分类:Physics        物理学
二级分类:Biological Physics        生物物理学
分类描述:Molecular biophysics, cellular biophysics, neurological biophysics, membrane biophysics, single-molecule biophysics, ecological biophysics, quantum phenomena in biological systems (quantum biophysics), theoretical biophysics, molecular dynamics/modeling and simulation, game theory, biomechanics, bioinformatics, microorganisms, virology, evolution, biophysical methods.
分子生物物理、细胞生物物理、神经生物物理、膜生物物理、单分子生物物理、生态生物物理、生物系统中的量子现象(量子生物物理)、理论生物物理、分子动力学/建模与模拟、博弈论、生物力学、生物信息学、微生物、病毒学、进化论、生物物理方法。
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英文摘要:
  The present paper is devoted to foundations of p-adic modelling in genomics. Considering nucleotides, codons, DNA and RNA sequences, amino acids, and proteins as information systems, we have formulated the corresponding p-adic formalisms for their investigations. Each of these systems has its characteristic prime number used for construction of the related information space. Relevance of this approach is illustrated by some examples. In particular, it is shown that degeneration of the genetic code is a p-adic phenomenon. We have also put forward a hypothesis on evolution of the genetic code assuming that primitive code was based on single nucleotides and chronologically first four amino acids. This formalism of p-adic genomic information systems can be implemented in computer programs and applied to various concrete cases.
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PDF链接:
https://arxiv.org/pdf/0707.3043
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