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2022-03-04
摘要翻译:
在这项工作中,我们提出了一个基于Taverna的工作流的开发,该工作流将通过MrBayes工具来实现系统发育计算。它具有使用Gridsphere框架开发的友好界面。用户可以定义进行贝叶斯计算的参数,确定进化模型,在中间阶段检查结果的准确性,以及将先前的序列与最终结果进行多重比对。要做到这一点,他/她方面不需要关于计算过程的知识。
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英文标题:
《PhyloGrid: a development for a workflow in Phylogeny》
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作者:
Esther Montes, Raul Isea, Rafael Mayo
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最新提交年份:
2010
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分类信息:

一级分类:Computer Science        计算机科学
二级分类:Computational Engineering, Finance, and Science        计算工程、金融和科学
分类描述:Covers applications of computer science to the mathematical modeling of complex systems in the fields of science, engineering, and finance. Papers here are interdisciplinary and applications-oriented, focusing on techniques and tools that enable challenging computational simulations to be performed, for which the use of supercomputers or distributed computing platforms is often required. Includes material in ACM Subject Classes J.2, J.3, and J.4 (economics).
涵盖了计算机科学在科学、工程和金融领域复杂系统的数学建模中的应用。这里的论文是跨学科和面向应用的,集中在技术和工具,使挑战性的计算模拟能够执行,其中往往需要使用超级计算机或分布式计算平台。包括ACM学科课程J.2、J.3和J.4(经济学)中的材料。
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一级分类:Quantitative Biology        数量生物学
二级分类:Other Quantitative Biology        其他定量生物学
分类描述:Work in quantitative biology that does not fit into the other q-bio classifications
不适合其他q-bio分类的定量生物学工作
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英文摘要:
  In this work we present the development of a workflow based on Taverna which is going to be implemented for calculations in Phylogeny by means of the MrBayes tool. It has a friendly interface developed with the Gridsphere framework. The user is able to define the parameters for doing the Bayesian calculation, determine the model of evolution, check the accuracy of the results in the intermediate stages as well as do a multiple alignment of the sequences previously to the final result. To do this, no knowledge from his/her side about the computational procedure is required.
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PDF链接:
https://arxiv.org/pdf/1012.3953
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