求助R PACKAGE biomark

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收藏 2011-06-14

各位老师同学，我用R 的biomark包
data(spikedApples)
apple.coef <- get.biom(X = spikedApples$dataMatrix,Y = rep(1:2, each = 10))
用他的数据没问题，我自己用excel编辑的数据却怎么都不行，提示ERROR: ncol(X)
不知道用我们自己编辑什么样的数据结构可以用它来处理，谢谢！

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DM小菜鸟

2014-12-15 14:17:58

这个提示是列向量出问题了吧
你检查一下你上下的命令和你的数据矩阵
有没有未标清名头的，要这样的格式——SpikePos$annotation[,c("rt", "mz")]

这里有一个小例子——

data(SpikeNeg)
plot(SpikeNeg$annotation[,c("rt", "mz")],
   xlab = "Time (s)", ylab = "m/z",
   main = "Negative ionization mode")
points(neg.markers[!is.na(neg.markers$feature.nr), c("rt", "mz")],
   pch = 19, col = 2)
　
要想进一步了解，数据扔上来的说~

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