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论文有可能被拒。谁都被拒过稿。只字不改就接受的论文极少，即使是最优秀的科学家，最漂亮的研究，也照样可能被拒或者被要求修改。不要消极对待目标期刊拒稿和退修要求，而应把它视为发表过程的一个环节，其目的是为了让你的论文在科学上尽可能更健全，以便将来被录用为科学文献，并成为“集体知识”的一部分。

期刊拒稿有各种原因，大多数在本系列讲座的前文中已经提及。 比如，如果对拟投期刊的选择不当，就有可能不送去审稿便直接拒稿。期刊定位恰当才能增加稿件获得同行评议的机会(参见第六讲“选择合适的目标期刊”中的注意事项)。同理，拙劣的投稿信也可能造成不经审稿便直接拒稿(参见第三讲“如何写出吸引读者的‘cover letter’”中的注意事项)。违反目标《稿约》的规定可能被期刊编辑认为不尊重对方，从而造成拒稿，当然更可能的是被要求修改格式后再投。其他拒稿原因包括研究设计有缺陷、论文写作语言水平不合格、研究方法或统计检验选择或解释不当、结果叙述不当或夸大其辞、引言和/或讨论不客观公正或缺乏细节；或者就是缺乏新颖性(比如你的研究只是简单重复别人已发表的工作) 、重要性或相关性。投稿之前严格分析你的论文，考虑审稿人会着眼的所有要素，你就可能提前发现这些问题。照着本讲座系列中的经验来做，就能加快从初投到录用的进度，并让其间的各个阶段相对顺利。所以，在投稿前值得尽全力完善文稿质量，以减小拒稿的可能。

关于同行审稿和如何应付，可以考虑一下审稿人会如何处理你的稿件。不同的期刊对审稿人的要求各不相同，但是他们基本上都会要求审稿人审查你的稿件是否满足如下这些良好科研和写作的要素；如果你的稿件不满足其中某项，审稿人还要写出相关评语。

重要性
•    结果对该领域的重要性是什么？
•    结果是否对会受到相关和更广范围的研究者关注？

新颖性
•    文中的主张是否足够新颖、因此值得发表？
•    研究是否在已有发表工作基础上取得进展？

引言
•    是否提供充分的背景信息，让非本领域读者能理解研究问题/假说？
•    研究的理由是否定义清楚？
•    为论证本研究工作所引文献是否充分恰当？
•    研究目的是否定义清楚？

方法/技术严谨性
•    所用方法对研究目的是否适当？
•    叙述的实验信息是否完整，能让其他研究者重复？
•    是否另需实验来验证该研究结果？
•    补充实验是否能显著提高该文质量？
•    对于已确立的方法，其引用文献是否适当？
结果/统计
•    结果解释是否清晰，表达方式是否恰当？
•    图表信息是否必要，是否更易于用文字表达？
•    插图和正文内部或二者之间数据有无重复？
•    图表是否易于解读？
•    是否需要补充插图以增加清晰性？
•    有否使用适当的统计学方法来检验结果的显著性？
讨论
•    有否考虑数据的所有可能解释，是否存在也能解释数据的备择假设？
•    有无在现有文献背景基础上适当说明结果？
•    满足上述标准同时是否引用了适当的参考文献？
•    有无讨论研究局限性？
结论
•    研究结论是否有适当证据支持，有无夸大？
•    是否清楚讨论了结果的重要性/应用性/意义？
文献引用
•    所引文献是否全面客观，有无遗漏重要研究，有无过分引用某些研究？
期刊选择
目标期刊是否恰当？
语言
稿件行文是否清楚、因此能被该领域以外的研究者理解？

当你收到退修信和审稿意见时，应仔细研读其中所有评语(包括编辑评语和审稿人评语)，根据需要在稿件中作出相应调整，然后撰写一份详细的回复函。通常需要返回修改稿和回复函(回复函和再投稿信可分为两个文件)，并且需要在规定时间之前返回，否则修改稿将被作为新稿处理。编辑和/或审稿人的所有意见都必须回应，即使你不同意其意见。若你对某点持反对意见，应该礼貌并有理有据地反驳。在反驳时，可以引用某论文来支持你的说法(如该文不在参考文献中，可以考虑将其收入参考文献列表)，可以解释为何某个实验是以某种特定的方式开展的，也可以是解释为何你不按照审稿意见去做补充试验。但无论如何，不要不理睬或忽略审稿意见，因为这只会导致延迟。只有所有意见都妥当回应之后，你的论文才有可能发表。
回复函最好的格式是把编辑和审稿人的意见复制下来，然后在各条意见下面逐条回应。审稿意见和回应要用不同字体加以区分(如正体和斜体)。当提到文中的改动时，给出页码和行号以便迅速查找。把修改前后的文字都复制在回复函中，让人一目了然你如何修改回应审稿意见。通常要在文中标记出主要改动之处以便查找，比如用黄色高亮和/或使用下划线/删除线。最后，若编辑或审稿人要求补充分析或者实验，你应该照办并把数据加入稿件；这会让稿件更富有说服力并增加发表的机会。