用过R和perl的高手请入

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收藏 2012-04-28

目前在做一些生物信息学的分析，但对于R不是太明白，用的较多的是perl和mysql，将mysql中的数据导给perl进行分析，鉴于R的强大绘图工具，不需要用GD另写程序，遂对R颇为心仪，但现在R刚起步，有几个问题想请教大家一下。

举个例，如果要作boxlplot的图，从mysql获得了几组数组后，如何将它们分别（因为数据是分别获取的）导入到一个list或dataframe中去，因为这些数据的长度都不一样，但都在上千万至亿不等，貌似dataframe需要数据长度是是成倍数变化（但我不需要它进行内部循换），有什么建议吗大家？

谢谢大家

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qoiqpwqr

2012-4-28 02:11:14

不懂sql，不过你可以看看RMySQL包

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yaanlpc

2012-4-29 01:57:00

因为是新手，所以我习惯于在perl解决问题，看来我得花点时间学R编程。

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DM小菜鸟

2015-3-3 17:17:10

> library(RMySQL) # will load DBI as well
   ## 打开一个MySQL数据库的连接
   > con <- dbConnect(dbDriver("MySQL"), dbname = "test")
   ## 列出数据库中表
   > dbListTables(con)
   ## 把一个数据框导入到数据库，删除任何已经存在的拷贝
   > data(USArrests)
   > dbWriteTable(con, "arrests", USArrests, overwrite = TRUE)
   TRUE
   > dbListTables(con)
   [1] "arrests"
   ## 获得整个表
   > dbReadTable(con, "arrests")
                  Murder Assault UrbanPop Rape
   Alabama       13.2    236    58 21.2
   Alaska          10.0    263    48 44.5
   Arizona          8.1    294    80 31.0
   Arkansas          8.8    190    50 19.5

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