你的结论是怎么得出来的？

这个问题有点意思，顶下

[XT] xtlogit -- Fixed-effects, random-effects, and population-averaged
                      logit models
re requests the random-effects estimator, which is the default. 是不是说如果不设xtlogit的模型选项的话，re是默认的。而且，手册上说
xtlogit fits random-effects, conditional fixed-effects, and
    population-averaged logit models.  Whenever we refer to a fixed-effects
    model, we mean the conditional fixed-effects model.这个conditional fixed effects model是什么意思？不是一般的ＦＥ？

[XT] xtlogit -- Fixed-effects, random-effects, and population-averaged
                      logit models
re requests the random-effects estimator, which is the default. 是不是说如果不设xtlogit的模型选项的话，re是默认的。而且，手册上说
xtlogit fits random-effects, conditional fixed-effects, and
    population-averaged logit models.  Whenever we refer to a fixed-effects
    model, we mean the conditional fixed-effects model.这个conditional fixed effects model是什么意思？不是一般的ＦＥ？

1、没错，在不指定任何选项的条件下，stata做xtlogit 默认的就是计算re 模型。而不是你最开始的意思。
默认设置是是人家软件编写的时候设置成那样的。
2、condition fe和fe是不一样的。你看看手册上介绍和greene书上的介绍吧