举例：
a<- c(1,2)
b<- c (1,2,3)
pie(a)
输出饼图1
pie(b)
覆盖饼图1并显示饼图2

par(mfcol=c(2,1))  par(mfrow=c(2,2))  可以设置在一个输出框中显示多图的功能

但不能解决上述的被覆盖问题。以下为本人得到的解决方案：
pie(a) 得到的饼图输出框上写着'R Graphics:Device 2 (ACTIVE)'  注意2这个参数
if(dev.cur==2) dev.new() 意思就是如果当前输出框的device为2则新建画布
pie(b)
如果要继续画pie(c) 则将上述if中的参数改为3

供大家参考交流~