孕妇血浆DNA测序在性连锁遗传病筛查中的应用
目的——开发一种基于孕妇血浆测序的胎儿性别鉴定方法,评价其作为筛检试验的可能性,及其在性连锁遗传病咨询中的应用潜能。方法——选取900例孕周为12-16周的、已知出生随访结果的孕妇血浆测序数据进行回顾性分析,其中训练集和验证集分别为100例和800例。
统计比对到Y染色体上的测序片段的百分比,基于ROC曲线方法选取性别鉴定分界值,并用于鉴定胎儿性别。招募8例杜氏肌营养不良症的携带者孕妇进行同步盲法测试,通过孕妇血浆测序,利用所建立的方法进行胎儿性别鉴定。
对性别鉴定错误样本进行全面的回顾分析,包括常染色体数目异常检测及临床记录。其中,常染色体数目异常检测通过建立引入内部参考染色体的Z检验方法进行。
结果——在训练集中,本方法对胎儿性别鉴定的灵敏度和假阳性率分别为96%和0%。在验证集中,423例男胎中421例成功鉴别,377例女胎中374例成功鉴别,灵敏度及特异性达到99.53%和99.20%,其余各项评估指标均达到筛检试验要求。
与羊水穿刺金标准对比,8例杜氏肌营养不良症携带者的胎儿性别鉴定均正确。引入内部参考染色体的Z检验方法对T13、 ...
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