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论坛 数据科学与人工智能 人工智能 深度学习
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2025-11-30

该数据集是由湖南大学联合中国科学院大学、字节跳动 Seed 团队于 2025 年发布的一个蛋白质生成数据集,相关论文成果为「An All-Atom Generative Model for Designing Protein Complexes」。

数据集构成 :

单链蛋白质数据集:含 187,494 个样本,覆盖多种蛋白质类型与功能,源自 PDB(18,684 个)、 Swiss-Prot(140,769 个)、 AFDB(28,041 个)数据库。多链蛋白质数据集:含 11,620 个样本,涵盖 2-6 链蛋白质复合物,支撑多链建模。数据源自 PDB 生物组装数据,排除 3 类样本:SAbDab 抗体数据库中的样本、含长度小于 30 的链(视为肽段)的样本、长度大于 2,048 或缺乏聚类 ID 的样本。研究人员训练时对多链样本随机裁剪:残基数超 384 的样本,以链间结合界面残基对为中心,保留最近 384 个氨基酸。

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