协整理论研究的是经济变量线性组合的平稳性；对于具有一阶单整的时间序列，若存在协整关系，则意味着它们的线性组合是平稳的。“协整”的概念与宏观经济学中的“均衡”（equilibrium）有着本质的联系，经济变量之间是否具有协整关系，成了它们之间是否达到均衡的证据。
这一理论是由诺贝尔经济学奖获得者Engel和Granger提出的。协整（Cointegration）理论则提供了对非平稳时间序列建模的重要方法。两人的开创性研究成果堪称计量经济学发展中的里程碑。
详细的你可以看一下http://www.nanfangdaily.com.cn/jj/20031016/pl/200310150662.asp。

看一下计量经济学的书就知道了。不过国内都把这个理论应用滥了。