银监会于2003年4月正式成立，内设15个司局，三个中心。其中监管部门5个，分别是银行监管一部、二部、三部、非银行金融机构监管部、合作金融机构监管部；再加上办公厅、政策法规部、监事会工作部，其他就是一些辅助性部门，如财会部、国际部、人事部、机关党委（宣传部）等等，三个中心是培训中心、信息中心和服务中心。此外还有一些跨部门的协调机构，如新协办、准入小组等等。

银监会下设36个银监局（31个省会城市和5个副省级城市），在地市一级设有银监分局，某些经济发达的县设有监管办事处。