很难给一个具体的标准需要根据具体情况决定，因为显然你分的类越多R方就越大么，如果取最大么干脆别分类算了，所以只能说是当分n类是R方已经足够大并且再分下去R方增加非常有限的时候，可以认为这样分是合理的。当然大部分时候通过谱系聚类图是可以感觉出来。至于R方计算我忘记hclust和agnes这两个函数是不是会有R方的输出，如果有的话最好，如果没有的话手动写一句算一下也没啥问题吧1-(总类内离差平方和)/(总离差平方和)。没记错的用cluster包里的agnes函数应该有R方的输出的。

我现在是已知有n个样本，需要知道分为几类比较合适，所以所求得的R方是逐渐递减的。
当分类越来越少时，我就无法判断每类中有什么元素，所以不太会求总类内离差平方和。