Affy中一个基因对应几个探针号，怎么处理成一对一关系

飞天小猫1117

9175

收藏 2013-12-11

基因芯片是hgu133plus2, 把cel文件用R提取出基因表达数据，发现每个探针号对应一个基因表达值，而一个基因对应几个探针号，也就是一个基因对应几个基因表达值，怎么处理成一个基因对应一个基因表达值呢，牛人们能给个代码吗，感激不尽！

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nuomin

2013-12-23 07:40:31

贴一个简单的矩阵，把你想要的结果写出来，这样想帮你也容易些

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zhumengjin

2013-12-31 21:25:14

# Function to average the expression of probesets which map to same gene
probeset2genelevel = function (x)
return(tapply(x, factor(rownames(eset)), mean))

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