"开放式创新"一书有较为清晰的讲述

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自主创新和合作创新没有冲突，区别点是自主创新所占的比例要大于合作部分，主要是核心技术或者重要部分的都是自主。共同创新各占的比例不分上下，投入相当。如果两者都打不到，便陷入“抄袭和拿来主义”！比如，我们在自主研发创新的基础上还需要在其他部分技术上进行合作。
企业内部创新一般跟企业外部创新之间存在比较，企业内部创新指企业内部创新是指企业针对企业自身，和所有的员工开展的作用于企业内部的创新。主要表现在企业的组织和制度的改革，核心能力的成长，文化以及效益等方面的领先。企业的外部创新指企业面对市场变化所做出的积极反应，从而使自己的企业处于行业领先地位所进行的创新。
自主创新多涉及企业的产品革新，内部创新多涉及企业的管理等创新，相关联的地方也许是自主创新与管理之间存在互相影响的关系。
希望能给你参考！

在我们这个星球上，如果以十平方英尺这种小面积来计算，最紧张的地方可能要数纽约中央火车站的问询处了。每一天，那里都是人潮拥挤，匆匆的旅客都争抢着询问自己的问题，都希望能够立即获得答案。对于问询处的服务人员来说，工作的紧张与压力可想而知。疲于应对可能是他们的共同感受。可柜台后面的那位服务人员却是个例外，他看起来一点也不 紧张，这实在是令人不可思议。这位服务人员的身材瘦小，戴着眼镜，一副文弱的样子，却要面对大量缺乏耐心和混乱的旅客，让人很难想象在如此巨大的压力面前他还能镇定自若。

没有冲突。因为在企业创新实践中，自主创新是依靠企业自身实力资源、自身研发团队、依据大数据来做的创新，而合作创新是从企业外部非内部寻求的一种共同科研创新的的一种合作方式。区别就是一个是内，另一个是外。合作创新的一个优势是可以引入对方的优势于其中。