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2015-01-22
数据是每个人1000个基因表达数据,共40个人(来自健康和有疾病的患者),所以数据可以聚成两类。现在是想要探索主要是哪些基因影响了这种分类结果。这是要用什么算法来分析?
用prcomp()时,得出的结果:"sdev"     "rotation" "center"   "scale"    "x"    每个代表什么?
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2015-1-22 12:16:01
关于第一个问题,可以用聚类进行分析;第二个,自己查看help文档;?prcomp
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2015-1-22 13:00:35
lazybear51 发表于 2015-1-22 12:16
关于第一个问题,可以用聚类进行分析;第二个,自己查看help文档;?prcomp
是对变量还是样本进行聚类?而且聚类只是看出数据的类别,我想分析的是主要是哪些基因影响了这种聚类结果
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2015-1-22 13:01:07
你这是微阵列数据吗?建议用EMA(easy microarray analysis,R的软件包)进行分析,还能画出热图来。。。
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2015-1-22 13:02:05
不介意的话,可以把数据传上来吗?我也想看下顺便分析一下。。。
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2015-1-22 14:36:47
曲散人终 发表于 2015-1-22 13:02
不介意的话,可以把数据传上来吗?我也想看下顺便分析一下。。。
麻烦你帮我分析一下
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