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如何用R打开cel文件
FLOWER370
23031 16
2015-10-31
图一 图二 图三 setwd("C:/statgen")getwd()
library(affy)
library(help=affy)
files<-dir(pattern=".cel")
AffyData<-read.affybatch(filenames=files)
exprsSet.RMA<-rma(AffyData)
exp.RMA<-exprs(exprsSet.RMA)
exprsSet.MAS5<-mas5(AffyData)
write.exprs(exprsSet.MAS5, file="mydata.txt")

这个是别人叫我写的语句，但还是做不出来，不知道是不是cel文件有问题？有问题的话要怎么下载，大四学生在做毕业专题，第一次用R，很多不懂，希望热心的大神能教我一下。谢谢谢谢~
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jiangbeilu
2015-11-1 11:07:25
楼主给个cel文件吧
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jiangbeilu
2015-11-1 12:07:22
搞了一个多小时，终于可以读文件了。
GSM1137.rar
大小:(2.18 MB)

只需: 1 个论坛币  马上下载

本附件包括：

  • GSM1137.CEL

提供一种解决方案，如下：
1 安装最新版本R，我用的是32位，一定注意使用32位R，且最新。我在64位上不行的。
2. 输入代码执行，要等很久的，注意网速要好一点：
复制代码


会有提示是否更新所有包,选择a
3.加载和读取：
复制代码

这里只是读取一个文件，我把cel文件上传给你，setwd里面是我文件所在的位置
命令执行后，打开txt文件即可查看到了。

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FLOWER370
2015-11-1 20:45:06
jiangbeilu 发表于 2015-11-1 12:07
搞了一个多小时，终于可以读文件了。提供一种解决方案，如下：
1 安装最新版本R，我用的是32位，一定注意使 ...
5.png
前辈你好，按照你的方法，我最后出结果了，但是我想问一下，这个可以直接在R里读出cel文件的内容吗？还有我的cel文件是不是不完整的？谢谢你的热心解答，不甚感激
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jiangbeilu
2015-11-1 20:48:39
FLOWER370 发表于 2015-11-1 20:45
前辈你好，按照你的方法，我最后出结果了，但是我想问一下，这个可以直接在R里读出cel文件的内容吗？还 ...
这个就是在R里读了cel文件，然后把cel文件转成txt文件啊
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FLOWER370
2015-11-1 20:52:25
jiangbeilu 发表于 2015-11-1 20:48
这个就是在R里读了cel文件，然后把cel文件转成txt文件啊
但是在R的界面里没有呈现出txt里的内容呀。能不能直接在R上面呈现
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