如例：某员工为公司进行一项设计，按合同，公司应支付其报酬48000元。不考虑其它税收的情况下，计算公司应代付的个人所得税税额。
1、应纳税所得额=[（48000-2000）*（1-20%）]/76%=48421.05元
2、应代付个人所得税=48421.05*30%-2000=12526.32元

我想问，如果不由公司代付，由其个人支付，应纳税所得额则为：
48000*（1-20%）*30%-2000=9520元。

为什么自己支付个税计算出来的税额和公司代付计算出来的税额不一样呢？