请教：R软件中 fisher.test 出的OR值是调整过的吗？

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收藏 2016-03-27

运行以下code，出来的OR值是2.511881，但其实OR应该是(4/26)/(4/66)=2.5385,请问R软件中这个计算的OR值有调整吗？
(N<-matrix(c(4,26,4,66),ncol = 2,byrow=T))
fisher.test(N)

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lqj530

2016-3-28 00:03:56

(4/26)/(4/66)=2.5385 是无条件的最大似然估计， fisher.test（）算的是条件最大似然估计，条件是指在给定边际总计后， n11决定了其他所有的单元格的计数， {nij} 的分布可以通过 P(n11=t) = f(t, n1+, n+1， n, OR)来表示，这个分布是非中心超几何分布。使得这个概率最大化的OR就是条件最大似然估计的OR.

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