燃料电池有三大类主要市场：固定电源、交通运输和便携式电源。
    固定电源应用是目前最大的市场固定电源市场包括所有的在固定的位置运行的作为主电源、备用电源或者热电联产的燃料电池，比如分布式发电及余热供热等。固定燃料电池被用于商业、工业及住宅主要和备份能发电，它还可以作为动力源可以安装在片源远位置，如航天器、远端气象站、大型公园及游乐园、通讯中心、农村及偏远地带，对于一些科学研究站和某些军事应用非常重要。固定电源应用在燃料电池主流应用中占比最大，其中美国市场目渗透率略高，大型企业的数据中心使用量呈较明显的上升趋势。
    除用于发电之外，热电联产（CHP）燃料电池系统还可以同时为工业或家庭供电和供热。
    图1：燃料电池具备多种主流应用

    图2：电动汽车等应用

    交通动力应用是目前关注度最高的燃料电池应用领域
    交通运输市场包括为乘用车、巴士/客车、叉车以及其他以燃料电池作为动力的车辆提供的燃料电池，例如特种车辆、物料搬运设备和越野车辆的辅助供电装置等。
    汽车用燃料电池作为动力系统是目前关注度最高的应用领域，这是目前是爆发最迅猛，也是关注度最高的应用领域。
    燃料电池为动力的叉车是燃料电池在工业应用内最大的部门之一。用于材料搬运的大多数燃料电池是质子交换膜燃料电池提供动力，但也有一些直接甲醇燃料叉车进入市场。目前正在运营的燃料电池车队有大量的公司，包括联邦快递货运、西斯科食品、GENCO、H-E-B 杂货店等。
    便携式电源市场包括非固定安装的或者移动设备中使用的燃料电池，目前相比锂电池的优势并不明显，因此市场渗透不快。