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3136 0
2016-11-01
有一个0 1矩阵 类似
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    0    1    1    1
[2,]    1    0    0    1    0
[3,]    0    0    0    1    1
[4,]    0    1    0    0    1

想要随机后  每行及每列的加和不变。用了vegan包中的permatswap函数
> mat
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    0    1    1    1
[2,]    1    0    0    1    0
[3,]    0    0    0    1    1
[4,]    0    1    0    0    1
> out <- permatswap(mat, times = 9, burnin = 20000, thin = 500, mtype = "prab")
> out$perm[[1]]
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    0    1    1    1
[2,]    1    0    0    1    0
[3,]    0    1    0    0    1
[4,]    0    0    0    1    1
确实能达到我想要的效果,但是我的矩阵有14000x9000这么大,随机起来很慢。
请问大家有没有更高效的办法,拜托了!


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