mydata["对应名称", ]

不行的。
我的rownames是用function生成的，我mode了一下，是不是必须改成char.才可以？
具体该如何做呢？

也就是，我的rownames是用split和substr这些function生成的

能否把关键部分的代码发上来，如果能让回答者在自己的电脑上也可重复你所遇到的问题的话，回答的效率会高很多。

可以呀，不过我不会发代码那种，我就是直接把code敲上去呗。
my_data,这是m by n的矩阵，我给他变成numeric，为了方便运算。
my_data <- apply( my_data,2,as.numeric )
然后，我把写好的字符串名称赋予矩阵行名称
rownames( my_datal ) <- bigrownam
然后我就想索引我的rownames，但是由于 bigrownam里面的字符都是substr等一些函数得到的，mode(bigrownam)=function，因此我解决不了，没法直接用which来进行行索引