其实也是利益

原因比较复杂，综合起来有以下几个主要原因：
1. 制式不同，很多车站不能合站设置。例如高铁采用无砟轨道，普速铁路采用有砟轨道；高铁曲线、限制坡度半径大，普速铁路曲线半径、限制坡度小。另外信号信号、通信等系统都有不小的差别。
2. 地方政府的诉求。一方面，许多城市规划了新区，新设高铁站有引导人流的作用，便于新城区的开发；另一方面，高铁进城对城市交通切割作用很强，交通部门、居民都不愿意。
3. 拆迁难。社会越来越民主，强拆几乎不可能，而老的火车站周边已经盖了很多房子，要引一条新铁路进老站，不是拆车站周边的一小片，而是沿着新铁路拆一大片，基础设施这种公益类的项目又赔不了几个钱，拆迁难度可想而知，很少有地方政府愿意干这种吃力不讨好的事情。

能说具体点吗？

有道理，谢谢！

还有历史的因素，很多城市因铁路而兴，比如株洲，城市沿铁路线扩展，火车站自然在市里。然而随着经济发展，高铁应运而生，为了不干扰市内，一般都设在郊区。如南昌，南昌站是传统的火车站，在市里；而南昌西站是高铁站，在郊区。