我在500强上市企业工作过. 有一点经验. 希望有用:  

1. 容易找到参考数据, 因为上市企业须要公开大量资料.
2. 上市企业通常由大型审计师(如四大)做审计, 数据可信度较高.
3. 上市企业要达到一定的要求才可上市, 表示它们的业务较成功. 以成功者作为参考目标, 对自己有帮助.
4. 上市企业通常有强大的合作伙伴, 可以作为自己选择发展伙伴的参考.
5. 上市企业对宏经济和ZF政策的反应较明确, 有助分析宏观影响.

对于数据分析，运用上市公司为研究对象有下列优势：
1. 在财务报表分析中非上市公司没有与股票相关的数据,比如股价和交易量。但是上市公司有。这对计算相关指标有帮助，比如说P/E 比率和beta
2. 上市公司业绩及其其他评估可以通过对比股市及其股市板块或工业行业很快得出相对结果
3. 上市公司是很多金融公司和分析师的研究对象，很多对应相关上市公司的研究结果可以很容易获得
4. 一般而言上市公司都要比非上市公司规模较大，能代表具体的工业走向

楼上都说的很好，说点补充观点吧。
上市公司的股价和业绩也有被人为操作的可能，长期的数据和深入分析公开数据可能更为可靠。
非上市公司也有很厉害的公司，只是内部数据很难拿到，不便于直接分析，当然也可以从一些侧面进行分析。