关于ggplot画图

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收藏 2017-05-16

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最近要画张图几个SNP不同基因型的表型均值统计图，类似于图1；但是我只想要上面一部分（20,25），可是加了 scale_y_continuous(limits = c(20,25))后变成了图2那样，是什么原因造成的，要怎样解决啊？谢谢各位大神解答！！部分数据：

SNP	GENO	MEAN	SD	SE
rs10114460	G/G	21.42	2.486	0.063206
rs10114460	G/C	21.85	2.826	0.07185
rs10114460	C/C	22.34	3.091	0.078588
rs10777585	T/T	23.04	0.2143	0.005449
rs10777585	T/C	23.37	3.047	0.077469
rs10777585	C/C	22.18	3.041	0.077316
rs1130371	A/A	22.44	3.122	0.079376
rs1130371	A/G	22.35	3.125	0.079452
rs1130371	G/G	22.03	2.877	0.073147

BMI_means_SE_error.png

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图2

BMI_means_SE.png

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BMI_means_SE.png

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图1

最佳答案

cheetahfly 查看完整内容

因为如果条形图的y轴只截取一段的话，该统计图表将具有一定的误导性，因此大神HADLEY WICKHAM在设计ggplot2包时，就没有考虑这样的操作。建议你也想想是否真的有必要这样做。如果确实需要，用如下的方法： library(scales) ... scale_y_continuous(limits=c(20, 25), oob=rescale_none) ...

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cheetahfly

2017-5-16 12:57:23

因为如果条形图的y轴只截取一段的话，该统计图表将具有一定的误导性，因此大神HADLEY WICKHAM在设计ggplot2包时，就没有考虑这样的操作。建议你也想想是否真的有必要这样做。

如果确实需要，用如下的方法：
library(scales)
...
scale_y_continuous(limits=c(20, 25), oob=rescale_none)
...