data a;
input id $ Y2001 Y2002; /*SAS 变量名不能数字开头， 就加了字母Y在前面*/
cards;
a 1 2
b 3 4
;
run;

proc transpose data=a out=b(rename=(col1=value)) name=time;
by id;
run;

结果就是你要的。

若变量名为数字时，不符合原始的SAS命名规则，但非要求变量名是数字，可以使用全局语句：option validvarname=any;

另
/*查看变量名*/
proc contents data=b;
run;
/*修改变量名*/
proc datasets library=work;
modify b;
rename col1=value _name_=time;
run;