除了对经验主义的直接冲击以外，“理论渗透观察”与“科学整体论”等科学哲学现代研究成果还有着更为广泛的影响。具体地说，由于这些成果清楚地体现了科学活动的不确定性，特别是，它不可能简单地被纳入某个固定的认识模式，或是用某个现成的方法论彻底地予以说明，从而也就为社会、文化、政治等传统认识下的“非理性成分”进入科学敞开了大门。更为具体地说，“科学活动不确定性”的一个直接结论，就是各种所谓的“非理性成分”或“外部因素”在实际科学活动中不仅不可能被彻底清除，而且具有与“内部因素”同样的重要性，如果不说更为重要的话。事实上这也正是现代所谓的“科学的社会—文化批判”的一个基本立场，从而也就对“传统的科学哲学研究”（这既包括逻辑实证主义的科学哲学研究，也包括“后实证的科学哲学研究”）构成了直接威胁，对此我们将在第三部分作具体介绍和分析。