如何删除数据框中100个以上数值为0的行

2613

收藏 2019-12-01

最近处理基因组数据，数据框data行为基因名称，列为样本名称（400个样本），
由于数值中存在不少的0值，需要处理：如果某个基因在100个以上样本中表达值为0，则删除该基因即该行。
如果删除全部为0的行或者删除数值含有0的还能搞定，加了限定0的数量就搞不定了。
敬请大神们指点，谢谢啦！

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

全部回复

2019-12-1 21:28:41

rownum = NULL
for(i in 1:nrow(data))
{
num = sum(data[i,] == 0)
if(num > 100)
{
rownum = c(rownum, i)
}
}

rownum是你要的行数的index

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

2019-12-2 02:36:59

data = data[rowSums(data == 0) <= 100,]

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

2019-12-2 15:40:46

谢谢两位大神，可以解决了

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

分享