你是想读入一行处理一行，然后再删除它吧？当然可以了，不过既然这样，还不如直接先把数据库分成几个小数据库再运算。

可以的 可以读入的大小受到计算机硬件的限制

因为文件实在太大了，如果一行行读入，根本不占内存，就是费cpu。
解决方案：readline函数
示例：
output<-file("D:/Rdata/output", "w")
con <- file("D:\\Rdata\\input")
open(con)
while (TRUE)
{
   line <- readLines(con, n=1)
   if (length(line) == 0) break
   cat(line, file = output,sep="\n")
}
close(con)

楼上高手啊