方差分析的基本思想是根据研究目的和设计类型,将总变异中的离均差平方和SS及其自由度分别分解成相应的若干部分,然后求各相应部分的变异;再用各部分的变异与组内(或误差)变异进行比较,得出统计量F值;最后根据F值的大小确定P值,作出统计推断。
例如,完全随机设计的方差分析,是将总变异中的离均差平方和SS及其自由度分别分解成组间和组内两部分,SS组间/组间和SS组内/组内分别为组间变异(MS组间)和组内变异(MS组内),两者之比即为统计量F(MS组间/MS组内)。
又如,随机区组设计的方差分析,是将总变异中的离均差平方和SS及其自由度分别分解成处理间、区组间和误差3部分,然后分别求得以上各部分的变异(MS处理、MS
区组和MS误差),进而得出统计量F值(MS处理/MS误差、MS区组/MS误差