第一综合排名方面，在影响力最大的两大排名（武书连版和网大）中，上海交大都是前四，而复旦都是五名之后

第二获国家级奖项方面：上海交大第二，而复旦是第五

第三 国家优秀博士论文数：上海交大近几年明显多于复旦，在2010年上海交大是5篇优博论文排第三，而复旦只有三篇2010全国优博论文公示 各校统计

第四 政府支持方面：上海交大近几年所获政府支持明显高于复旦，比如首期投资6个亿的高级金融学院放在交大，国家医学中心也放在交大，等等。

第五 上海交大有几个国家实验室，而复旦没有国家实验室

第六 在高端论文发表数量特别是SCI数量方面，上海交大更是摇摇领先复旦