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2022-03-03
摘要翻译:
海量多组学微生物组数据库(M3DB)是一个数据仓库和分析解决方案,旨在利用NGS技术处理在典型微生物组项目中获得的多样、复杂和前所未有的序列和分类学分类数据。M3DB是一个基于Apache Hadoop、Apache Hive和PostgreSQL技术开发的平台。它使用户能够存储、分析和管理大量数据,并提供以快速有效的方式查询数据的能力。M3DB框架包括处理和存储微生物组数据的命令行工具,以及用于上传、查询、分析和可视化数据和/或结果的易于使用的Web界面。可用性:M3DB的源代码可在http://www.github.com/nisheth/M3DB免费下载。
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英文标题:
《Massive Multi-Omics Microbiome Database (M3DB): A Scalable Data
  Warehouse and Analytics Platform for Microbiome Datasets》
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作者:
Shaun W. Norris, Steven P. Bradley, Hardik I. Parikh and Nihar U.
  Sheth
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最新提交年份:
2015
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分类信息:

一级分类:Quantitative Biology        数量生物学
二级分类:Other Quantitative Biology        其他定量生物学
分类描述:Work in quantitative biology that does not fit into the other q-bio classifications
不适合其他q-bio分类的定量生物学工作
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英文摘要:
  Massive Multi-Omics Microbiome Database (M3DB) is a data warehousing and analytics solution designed to handle diverse, complex, and unprecedented volumes of sequence and taxonomic classification data obtained in a typical microbiome project using NGS technologies. M3DB is a platform developed on Apache Hadoop, Apache Hive and PostgreSQL technologies. It enables users to store, analyze and manage high volumes of data, and also provides them the ability to query it in a fast and efficient manner. The M3DB framework includes command line tools to process and store microbiome data, along with an easy-to-use web-interface for uploading, querying, analyzing and visualizing the data and/or results. Availability: The source-code of M3DB is freely available for download at http://www.github.com/nisheth/M3DB.
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PDF链接:
https://arxiv.org/pdf/1512.03674
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