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2022-03-07
摘要翻译:
我们用介观非平衡态热力学理论来描述RNA在张力作用下的展开。该理论引入了反应坐标,表征了分子中每个键的连续状态。所考虑的展开是如此缓慢,以至于人们可以在反应坐标的空间中假定局部平衡。在高序贯障碍的准平稳极限下,我们的理论得到了最近提出的一个序贯步长模型的主方程。在开态和闭态之间存在非线性开关动力学。我们的理论统一了热力学和动力学描述,并提供了一个系统的程序来表征展开过程的动力学
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英文标题:
《Unifying thermodynamic and kinetic descriptions of single-molecule
  processes: RNA unfolding under tension》
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作者:
J.M. Rubi, D. Bedeaux and S. Kjelstrup
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最新提交年份:
2007
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分类信息:

一级分类:Physics        物理学
二级分类:Statistical Mechanics        统计力学
分类描述:Phase transitions, thermodynamics, field theory, non-equilibrium phenomena, renormalization group and scaling, integrable models, turbulence
相变,热力学,场论,非平衡现象,重整化群和标度,可积模型,湍流
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一级分类:Physics        物理学
二级分类:Soft Condensed Matter        软凝聚态物质
分类描述:Membranes, polymers, liquid crystals, glasses, colloids, granular matter
膜,聚合物,液晶,玻璃,胶体,颗粒物质
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英文摘要:
  We use mesoscopic non-equilibrium thermodynamics theory to describe RNA unfolding under tension. The theory introduces reaction coordinates, characterizing a continuum of states for each bond in the molecule. The unfolding considered is so slow that one can assume local equilibrium in the space of the reaction coordinates. In the quasi-stationary limit of high sequential barriers, our theory yields the master equation of a recently proposed sequential-step model. Non-linear switching kinetics is found between open and closed states. Our theory unifies the thermodynamic and kinetic descriptions and offers a systematic procedure to characterize the dynamics of the unfolding process
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PDF链接:
https://arxiv.org/pdf/709.2609
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