985工程三期拨款  款项来源  
北京大学  40亿  教育部拨款
清华大学  40亿  教育部拨款

南京大学  28亿(14亿+14亿)  教育部拨款+江苏省拨款
浙江大学  26.2亿(13.1亿+13.1亿）  教育部拨款+浙江省拨款
复旦大学  26亿(13亿+13亿)  教育部拨款+上海市拨款
上海交大  26亿(13亿+13亿)  教育部拨款+上海市拨款

中国科大  18亿(6亿+6亿+6亿)  教育部+中科院+安徽省拨款
西安交大  15亿(12亿+3亿)  教育部拨款+陕西省拨款
武汉大学  15亿(7.5亿+7.5亿)  教育部拨款+湖北省拨款
华中科大  14亿(7亿+7亿)  教育部拨款+湖北省拨款
南开大学  14亿(7亿+7亿)  教育部拨款+天津市拨款
中山大学  13.4亿(6.7亿+6.7亿)  教育部拨款+广东省拨款
天津大学  13亿(6.5亿+6.5亿)  教育部拨款+天津市拨款
东南大学  12亿(6亿+6亿)  教育部拨款+江苏省拨款
哈工大  未知  教育部+国防科工委+黑龙江省拨款
四川大学  未知  教育部拨款+四川省拨款