城乡二元结构的存在实质，就是：城市的运作所产生的代价耗费，要由农村承担。按正常情况，谁产生耗费成本，谁来承担，而不能转嫁给别人。但是在特定体制之下，产生了耗费补偿的错位，从而产生出一种二元结构，一元所产生的耗费成本，要由另外一元来承担。
由此说明了事实存在的耗费补偿理论的意义。