菠萝SWEET基因家族的进化和功能分析
菠萝(Ananas comosus(L.)Merr.)属于凤梨科(Bromeliaceae),是世界上闻名的热带和亚热带水果之一,也是我国重要的经济作物。菠萝果实含糖量是决定菠萝品质和产量的重要因素之一。
果实中糖的累积主要通过碳水化合物代谢,光合同化产物主要以蔗糖的形式运输到库器官,给库器官生长发育提供能量。糖外排转运蛋白(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)是一组最近确定的植物糖转运蛋白,在不同的生理过程中发挥重要作用。
然而,目前关于这个基因家族的信息在菠萝中很少涉及。最近发布的菠萝基因组为调查菠萝SWEET基因在全基因组水平上的组织和进化特征提供了一个很好的机会。
本研究利用比较基因组学鉴定出菠萝基因家族成员,利用一系列的生物信息学方法提供了菠萝SWEET基因的系统描述,利用转录组数据(RNAseq)分析不同基因的表达模式,鉴定了在菠萝果实发育方面可能起作用的SWEET基因,以期为菠萝的分子育种提供依据。主要研究结果如下:(1)以拟南芥SWEET基因为参考,通过比较 ...