Prism 11.0.0
Prism 11为高级科研工作流引入了强大的新功能。Prism Pro与Enterprise版用户现在可使用备受期待的计算变量功能,通过电子表格风格的公式进行定义;支持无需重构数据即可处理复杂析因涉及的统一多因素方差分析(ANOVA);提供全面的效应量报告;并可直接从多变量数据表运行常见的经典分析。全新的数据表管理工具、非线性回归分析的优化,以及大量绘图功能与稳定性的提升。
表内公式计算变量
直接在多变量数据表内使用电子表格风格公式转换数据。
熟悉的电子表格体验:与Excel或Google Sheets类似,输入“=”即可开始编写公式。即可执行单位转换、比值计算等简单操作,也可通过函数与运算符的组合构建更复杂的计算。与逐单元格运算的电子表格公式不同,Prism公式可一次性对整个变量进行运算。
实时更新:可随时编辑变量公式。当源值发生变化时,计算值会自动更新。生成的变量可在任何支持多变量数据表的分析中,作为自变量、因变量或分组变量使用。
更整洁的项目文件:生成的变量会直接成为数据表的一部分,而非独立的转换或分析工作表。这让您可以为特定分析生成转换变量,使项目文件更整洁,工作流更高效。
3种快速访问方式:可通过以下三种方式快速开始转换:在任意单元格种输入“=”、从工具栏选择,或通过“插入→转换数据”菜单。
计算变量的重要性
这是Prism中最受用户需求的功能之一。此前,像比率计算或对数转换这类简单操作,都需要创建独立的分析工作表,这会让导航栏变得杂乱,也难以追踪工作流。现在,您可以直接在数据表中通过公式完成这些转换,且公式会自动更新,就像Excel或Google Sheets中操作一样。这能大幅节省日常数据预处理的时间,并让项目保持有序。
*需要Prism Pro或Prism Enterprise
多因素方差分析
适用于任意复杂程度的析因设计分析。
极致灵活性:通过统一界面与工作流,轻松处理单因素至N因素设计
拖拽操作:可从多变量数据表中便捷指定响应变量与分组变量
无需重组数据:添加或移除因素时无需重构数据,每行代表一个观测值,每列代表一个变量
完整事后检验套件:可选择校正方法,对主效应、简单效应或逐单元格模式进行比较
析因实验的现代解决方案
在传统Prism ANOVA中,不同因素数量的实验需要对应不同的数据表格式;若要增加第三个因素,则必须完全重构数据。多因素ANOVA彻底消除了这一限制:所有析因设计均可使用同一张多变量数据表,仅需重新分配变量即可添加或移除因素,无需在实验设计迭代时重建数据表。无论您是研究药物、基因型与时间如何共同影响基因表达,还是探索多种环境因素如何作用于生物行为,多因素ANOVA都能提供现代科研所需的强大统计能力与灵活操作。
*需要Prism Pro或Prism Enterprise
基于多变量数据表的经典分析
一种全新的统一方案,让您在数据组织与分析方式上获得更大的灵活性。
通过为变量分配分析角色,您可以直接从多变量数据表中执行t检验、非线性回归及生存分析。
- 统一表格,多种分析:以统一的数据结构组织数据,并可执行t检验、非线性回归及生存分析,未来版本还将支持更多分析类型
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- 直观的变量分配:指定哪些列作为响应变量,哪些用于定义实验组别(以及配对分析中的匹配受试者)
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- 无缝切换:通过重新分配变量来更新分析设计,无需重新组织数据
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- 多因素支持:对于非线性回归和生存分析,可指定多个分类变量,Prism会为每种组合生成独立结果
为何重要
此前,t检验需要列数据表,非线性回归需要XY数据表,而生存分析则需要生存数据表。如果在一次实验中测量了多个变量,就必须为每个分析创建独立的表格,或确保数据结构能适配每种检验。现在,您只需在一张多变量数据表中组织数据,然后通过分配变量即可运行任意分析,无需重新格式化。本版本已包含三种核心分析类型,未来版本还将扩展这一框架。当然,您仍可像以往一样直接使用列、XY或生存数据表,这一框架只是为您提供了更多数据结构上的灵活性。
实际应用示例:
- 生物标志物t检验:想要在两个实验组之间对特定生物标志物进行t检验?只需指定响应变量和分组变量即可。需要更换为另一个生物标志物?只需重新分配响应变量
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- 剂量-反应曲线:需要为多种细胞系在不同条件下拟合剂量-反应曲线?指定预测变量、响应变量和分组因素,Prism会为每种组合生成独立的回归分析
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- 多因素实验:变量分配界面让您可以直观地指定哪些列作为响应变量、哪些用于定义实验组别,以及(在配对分析中)哪些用于识别匹配的受试者
*需要Prism Pro或Prism Enterprise
完整效应量报告
报告效应的幅度,而非仅统计显著性。
Prism 11在多种分析中扩展了效应量报告功能,以支持现代统计解读与发表标准。
- 超越P值:不仅报告效应是否存在,还报告效应的大小与实际意义
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- 置信区间:在方差分析、列联表及t检验中,效应量均附带置信区间
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包含的指标
- 方差分析:η²(eta-squared)、偏η²(partial eta-squared)·、Cohen's f(支持单因素、双因素、三因素、重复测量及多因素方差分析)
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- 列联表:大表使用Cramér'sV,2×2表使用Phi系数,并通过推荐的自助法(bootstrap)计算置信区间
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- t检验:所有t检验类型均提供Cohen's d及其置信区间
为何重要
Prism现在会自动计算并报告此前需要手动计算或借助其他软件查询的效应量。这一更新使Prism符合现代发表标准,许多期刊现在要求在报告P值的同时提供效应量。将这些指标直接内置到结果中,可节省时间,并确保您无需额外步骤即可满足当前最佳实践。
*需要Prism Pro或Prism Enterprise
完整版本发布说明
新功能
多因素方差分析
实现了针对含多因素的复杂实验设计的多因素方差分析。
基于多变量(MV)数据表的经典分析
在分析对话框中新增变量分配选项,支持从多变量数据表执行以下经典分析:
- 支持从多变量数据表执行非线性回归分析
- 支持从多变量数据表执行生存分析
- 支持从多变量数据表执行t检验分析
计算变量
新增直接在数据表内执行数据转换的功能。
功能改进
*Prism Pro与PrismEnterprise
效应量
新增以下分析的效应量计算:
多元线性回归
对于包含分类变量交互项的模型,Prism现在会在结果中输出完整的ANOVA表(此前仅提供基础版本)。
*全部Prism License可用
非线性回归
- 为逻辑增长函数新增了“拐点=(1/k)*ln((YM-Y0)/Y0)”的变换公式
- 在非线性回归的“范围”选项卡中,新增了“当X为系列时,不拟合点”的选项
数据表管理
性能改进
- 当修改多变量数据表中未作为分析输入的变量时,Prism现在可避免不必要的重新计算
- 提升了在大数据集上执行“相关性分析”和“标准曲线插值”分析时的计算性能
- 提升了在大数据集上执行“相关性分析”“选择与转换”“提取与重排”“简单线性回归”或“函数绘图”分析后,在Prism项目中切换工作表的性能
- 提升了在大数据集上执行“相关性分析”“选择与转换”“提取与重排”“简单线性回归”或“函数绘图”分析后,不保存直接关闭项目时的性能
- (Mac平台)提升了在重新计算大部分分析后,不保存直接关闭项目时的性能
- (Mac平台)提升了在大数据集上执行“提取与重排”分析时的性能
分析相关Bug修复
- 修复了双因素方差分析中,文本结果错误地显示模型中不存在交互效应的问题
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- 修复了当数据表中包含值完全相同的列时,相关性分析结果表显示空单元格而非“r=1”的问题
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- 修复了在分析参数对话框中修改选项后,层次聚类分析的肘部图(Elbow plot)、轮廓图和缺口图数据未更新的问题
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- (Windows平台)修复了当源数据表包含缺失值时,采用Dunnett检验的双因素方差分析多重比较结果中,差值置信区间(CI of diff)缺失的问题
绘图相关Bug修复
- 修复了当首个数据集包含缺失值或排除值时,分组叠加散点图上未显示总均值/中位数线的问题
- 修复了即使某段坐标轴范围超出尖峰对应数值,XY图上该尖峰的部分仍意外显示在该轴段上的问题
- 修复了当因变量从数据表中被排除或删除时,主成分分析(PCA)生成的主成分得分图上的符号标签未被移除的问题
- 修复了执行“Magic”命令后,附加网格线的颜色未应用到气泡图的问题
- 修复了在主成分分析中修改分析参数后,载荷图的坐标轴最小/最大值未更新的问题
- 修复了更新多变量图时,若分类水平被删除后又通过“撤销”命令恢复,会导致图例丢失和颜色分配错误的问题
- (Windows平台)修复了对嵌套图中单个条形应用的格式设置错误地影响整个数据集的问题
- (Windows平台)修复了使用“SendToPP”脚本将多个布局图从Prism导出到MS PowerPoint时,图形显示尺寸变小的问题
- (Windows平台)修复了在复制数据系列并为每个数据集创建图形时,图形标题未自动更新以反映分析数据表中新列标题的问题
- (Windows平台)修复了重新打开保存的PZFX/PZF项目时,生存分析图出现损坏,且无法查看结果和图形工作表的问题
- (Windows平台)修复了在嵌套图上应用自定义范围时,浮动条形和箱线图出现损坏的问题
- (Windows平台)修复了在布局工作表上放置包含大量数据的XY图后,添加了特殊符号的文本对象意外变为粗体的问题
- (Windows平台)修复了多变量图上的符号颜色及图例顺序在 .pzfx/ .pzf文件中被意外更改的问题,当数据表中某一水平先前被替换时
- (Windows平台)修复了在多变量图上使用Magic工具时,混合默认值和自定义轴标题导致周标题更新不一致的问题
- (Windows平台)修复了在导出带有大号Y轴编号字体和负最小值的图形时,底部Y轴标签被截断的问题
- (Mac平台)修复了在执行Magic操作后,行/列标签位置未应用到目标热图的问题,当示例图的标签位置被设置为“左”或“上”时
- (Mac平台)修复了添加到布局工作表的文本在导出为EPS格式时,因默认不透明度为85%而出现模糊和光栅化问题