中文系一般指“中国语言文学系”，从名字就可以看出，包括“语言”和“文学”两大部分。通常“X语系”都是这个意思，比如法国语言文学系，德国语言文学系等。

文学和语言两大部分，侧重点不一样。详细的说明请参看@清洁工的答案，简洁而严谨，我这里只是笼统地一说。

“文学”这一边更“艺术”一些，比如李白杜甫、唐宋八家，四大名著，鲁郭茅巴老曹等等，重点关注的是“文学作家作品”，比如这些作家作品的时代、内容、表现手法、思想内涵。抽象一些的内容包括文艺理论、文学批评等等。

语言学这一边更“理性”一些，比如语音、词汇、句法、语义、语用等等，小到个别语言学，比如汉语语言学、英语语言学，研究某一种语言的结构特点；大到普通语言学，研究人类语言的共同特征，研究人们是怎么说话的，为什么会这样说。

用中小学的语文课的内容来作不恰当的类比，比如文学常识、段落大意、中心思想以及“这句中的这个词用得好不好？为什么好？换成另一个词行不行？”等问题，大体属于“文学”的问题；而词语搭配，比如小学时的“一张（）、一条（ ）、一片（ ）”，中学时的改病句，划句子成分（主谓宾定状补）等等，大体属于“语言”的问题。当然，作为大学专业的语言和文学比这些高档多了，这里只是类比一下而已。

用《红楼梦》作个例子，文学视角下的红楼梦，关注作者是怎么想的，为什么要这样写，荣宁二府的繁华与衰败象征着什么，各个人物的性格与命运，各种事件的象征意义……全书那么多诗词是如何如何美，如何如何妙等等；语言学视角下的红楼梦，会关注诸如红楼梦的语法特征，作为“近代汉语”的典型代表，红楼梦的语句中可以找到汉语演变的什么证据，可以看到比如“把字句”中的“把”从动词向副词变化的过渡阶段等等。文学和语言的视角是不一样的。

另外，说句题外话，文学是大厦，语言是砖瓦，其实两者的关系是非常紧密的。但是现今由于这种专业上的分野，使得文学和语言的研究基本结合不起来，学文学的和学语言的人互相鄙视，其实也是个挺不好的局面。不过话说回来，这两个方向如何结合，也是个挺难解决的问题。