以前有一项科研补贴，每月500元，有一年科研没有达标，那年写了一本书，后来规定专著不算，今天六月份工资中扣除了以前发的补贴费3000元，本月只开了2500元，但个人所税还是按以前的扣了110元，我没有拿到这3000元，但是交了这3000元的个人所得税。合理，合规，全法吗？