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R语言 Cox回归 数据分层
楼主
名字不很酷
12552
4
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2016-03-29
各位大神,想问下Cox回归中设定了分层变量(level=2),也就是说会将数据按照不同的两层进行拟合,coxph()得出的其他变量的参数应该有两套啊,为什么只有一套呢?代码和输出结果如下:
>cox1<-coxph(Surv(days,status==1)~log(thick)+sex+strata(ulc))
#这是模型,包含了一个分层变量ulc;
> summary(cox1) Call:coxph(formula = Surv(days, status == 1) ~ log(thick) + sex + strata(ulc)) n= 205, number of events= 57 coef exp(coef) se(coef) z Pr(>|z|) log(thick) 0.5599 1.7505 0.1784 3.139 0.0017 **sex 0.3600 1.4333 0.2702 1.332 0.1828
#sex和log(thick)的系数估计值只一个,是针对哪一层的呢
---Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 exp(coef) exp(-coef) lower .95 upper .95log(thick) 1.750 0.5713 1.234 2.483sex 1.433 0.6977 0.844 2.434Concordance= 0.673 (se = 0.058 )Rsquare= 0.063 (max possible= 0.9 )Likelihood ratio test= 13.3 on 2 df, p=0.001296Wald test = 12.88 on 2 df, p=0.001598Score (logrank) test = 12.98 on 2 df, p=0.00152
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沙发
seanfang1992
2016-6-23 20:10:08
我刚刚也做了,我觉得他是按ulc分层后,ulc各个曾经做的分析?求高手指点咯
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藤椅
xjh_109
2016-8-31 09:39:27
我也弄清楚了,确实是针对strata(ulc)中的ulc分类进行的,我修改了下,是这样进行的!
cox1<-coxph(Surv(days,status==1)~log(thick)+sex,data=mydata[ mydata$gender==1 ,])
这样的结果是针对gender赋值为1的分组进行HR分析!
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板凳
立妍Z
2021-5-24 10:56:11
请问,楼主解决了嘛,我现在也有同样的疑惑
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报纸
jcx350
2021-5-30 17:44:51
立妍Z 发表于 2021-5-24 10:56
请问,楼主解决了嘛,我现在也有同样的疑惑
可以看下,分层cox回归的定义,里面有个假设,是假设所有层的系数(即beta)的值是相等的,因此,这里算出来的系数并不是看哪一层的。可以说是,所有层的系数是相等的。这里分层cox回归主要是假设,不同层之间的基。准危险函数是不同的(即违背了风险成比例这一个假设)。希望可以对你们有所帮助、
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