他是国内第一位公开对抗教育部本科评估的大学校长，他是高校扩招潮中第一个顶住压力反扩招的大学校长，他还是在多个场合炮轰高校“官化”和“行政化”的大学校长，在网上，他被称作“中国最牛大学校长”，甚至有媒体直接称他为当代的“蔡元培”。现在，他和他的治学理想来到深圳，着手筹办一所可能引发这座城市甚至全国高校教育剧烈震荡的大学。他同这座城市一样，先锋、敢于突破常规、勇于实验。他唯一和这座城市有所不同在于，他拥有一种理想化的学者精神，而这个城市相形之下，太务实了。他说，他的学校要引领这座城市的文化，要点燃中国高等教育改革的第一把火，但他也承认，南方科技大学第一个这样做，但有可能不是第一个成功的。 南科大行政人员待遇将比深圳公务员高
担任中科大校长时，朱清时是反高等教育体制弊端的高调斗士，他抨击教育部本科评估形式化，他反扩招，因此，当他被深圳选聘为南方科技大学校长后，他说，南方科技大学将要去官化、去行政化。南科大将参考香港科技大学的模式，香港科大教授月薪是十几万，南科大教授的薪酬水平与此基本一致。
微观深圳：南方科大的行政人员没级别没权力，一切以教授为中心，那么谁来监督教授？显然我们不能把高校的学术端正寄托于个人道德素质。
朱清时：大学要办好有3个要素，第一是大家追求卓越而不是追求官大，追求学术卓越，业务做得越好，大家越崇拜；第二是学术要自由，不能有行政权力干预学术；第三是学者要自律，大学才能得到资助，社会相信你们都会干好事，确实是象牙塔中间的人，你自己都不能自律的话，失去公信力，社会就不会支持学校。所以监督学者的主力还是社会，最好的体制就在世界上大学办得最好的地方：政府和社会投资很多，有足够的钱来支持学校发展，政府和社会又有强有力的机制监督学校发展。我举个例子，香港的大学全都是政府办的，出很多钱，香港的政府官员不能直接去管大学，如果管大学它就是行政干预，所以他们设置了一个叫大学拨款委员会的机构，来监督学校的各种运行，比如学校请的人合不合理、课程设置合不合理、教学质量好不好，它把监督的结果报告给政府，政府依据这个报告再给学校拨款。它们的结构是三角形的，大学拨款委员会有点像议会，使得政府不直接干预学校，但是政府又有把握学校的运行受到了最严格的监督。
微观深圳：南方科技大学会采用这样的监督机制？
朱清时：是否成立像香港大学拨款委员会这样的机构，要全国来做，光深圳不行。我们希望的制度设计是深圳市人大常委会为南方科大立法、通过南方科大章程。人大常委会应该有个下属委员会，这个下属委员会来监督立法的执行，起到大学拨款委员会的作用。这个下属委员会的成员不一定是人大的常委，他们可以是人大聘请的各种专家、社会知名人士甚至各界人士，专门监督南方科大。人大常委会监督比政府监督好，它没有实权，它就是监督机构，它提意见给政府参考，政府才有实权来拨款。当然监督主体里还应该包括媒体。
微观深圳：行政人员没级别没权力，学校靠什么吸引优秀的行政人才？待遇？
朱清时：不知道你清不清楚，香港大学里的秘书相当于当地公务员，待遇很高。南方科大行政人员的待遇还会比深圳的公务员要高一些，高到多少呢，要看社会的承受能力。它至少要高到社会上的精英都愿意来竞争这个位置，这样学校管理人员的水平才会高，而且竞争到这个待遇后即便没有行政级别也无所谓。今后我们要尝试的，究竟要高到什么程度才能符合大家的期望。但毫无疑问，一定要比现在公务员的待遇高。
把大学办成世界一流，不优待深圳生源
朱清时描绘的南方科技大学如果建成，无疑成为中国高等教育体制背景下的一个异类，一个充满理想色彩、先锋精神的乌托邦式大学。但这所大学要扎根于深圳的土地，不得不面对很多现实问题，例如本地化招生。本地化招生已经成为深圳大学每年必经的折磨，导致这所曾经宣称要建成世界一流大学的高校每每困扰于生源质量。朱清时说，解决这个问题，一靠政府的决心，二靠市民的觉悟，三靠设计优秀的体制。
微观深圳：怎么处理本地化招生问题？一座用深圳纳税人的钱建设的大学，能不考虑本地优先录取吗？
朱清时：一个城市要办成世界一流，它一定要有超过眼前利益的东西。温总理说，我们人类中间一定要有一些仰望星空的人才行，不是什么事情都要眼前得益。深圳办南方科大，深圳人民得到最好的回报就是南方科大办成世界一流了，深圳的知名度大大提高了，以后，深圳的各项事业都会水涨船高，这个时候大家就得到回报了。如果把回报看成你办好了我的子女都要来上你的学，大学肯定办不好。
微观深圳：你能顶住压力吗？
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