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2019-07-27
代码是fit <- survfit(Surv(futime, fustat) ~ risk, data = rt)summary(fit)    #?鿴??????????
ggsurvplot(fit,data=rt)
pdf(file="survival.pdf",width=5.5,height=5)
ggsurvplot( fit,
            data = rt,
            size = 1.5,# change line size
            xlab="Time (year)",
            ylab="Survival rate",
            palette = c("#E7B800", "#2E9FDF"),# custom color palettes
            conf.int = FALSE, # Add confidence interval
            pval = TRUE, # Add p-value
            risk.table = FALSE, # Add risk table
            risk.table.col = "strata",# Risk table color by groups
            risk.table.height = 0.25, # Useful to change when you have multiple groups
            ggtheme = theme_bw() #Change ggplot2 theme
            )
dev.off()

结果画出来的是

我想把上边的框框去掉,只保留xy坐标轴,就像下图那样:

求助各位大佬!!谢谢!



附件列表
QQ图片20190727230733.png

原图尺寸 18.8 KB

QQ图片20190727230733.png

2019-07-27_22-59-27.png

原图尺寸 28.79 KB

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2019-7-30 23:24:53
没人回答么……自顶一下
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2019-7-31 13:43:50

ggtheme里面改成ggtheme = theme_classic()

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2019-7-31 22:26:39
caimiao0714 发表于 2019-7-31 13:43
ggtheme里面改成ggtheme = theme_classic()
万分感谢!!
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2019-8-6 22:57:05
caimiao0714 发表于 2019-7-31 13:43
ggtheme里面改成ggtheme = theme_classic()
那能不能再问一下,如果是下述的生存曲线程序,应该怎么做到同样的事呢?
tiff(file=paste(picDir,"\\",gene,".survival.tiff",sep=""),
       width = 14,            
       height =14,            
       units ="cm",
       compression="lzw",
       bg="white",
       res=600)
  plot(fit,
     lwd=2,
     col=c("red","blue"),
     xlab="Time (year)",
     mark.time=F,
     ylab="Survival rate",
     main=paste(gene,"(p=", pValue ,")",sep="") )
  legend("topright",
       c("High","Low"),
       lwd=2,
       col=c("red","blue"))
  dev.off()
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2019-8-7 09:19:54
wukequdaidef 发表于 2019-8-6 22:57
那能不能再问一下,如果是下述的生存曲线程序,应该怎么做到同样的事呢?
tiff(file=paste(picDir,"\\", ...
默认的plot函数我就不清楚了,我一般都只用ggplot2。
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