税务处理如下：
　　
　　对于正常的存货损失，会计处理等同于税法，在本年利润中直接扣除；对于存货的非正常损失，会计上分两种情况在本年利润中直接扣除，即自然灾害损失，在扣除保险公司等赔偿后记入“营业外支出”，而因管理不善造成货物被盗窃、发生霉烂变质等损失，扣除有关责任人员赔偿后记入“管理费用”。
　　
　　1、增值税方面
　　
　　企业发生非正常损失的购进货物，其进项税额不得从销项税额中抵扣。如果企业在货物发生非正常损失之前，已将该购进货物的增值税进项税额实际申报抵扣，则应当在该批货物发生非正常损失的当期，将该批货物的进项税额予以转出。
　　
　　2、所得税方面
　　
　　对于因“管理不善”记入“管理费用”和因“自然灾害”记入“营业外支出”的存货非正常损失，如果具备第13号令中规定认定的证据，经税务机关审查批准后，准予在当期所得税前扣除。
　　
　　有关存货盘亏和毁损的税务处理可以具体参照国家税务总局第13号令。企业发生的存货非正常损失，应当在年度终了后15天之内报所属税务机关备案或批准，才能在企业所得税前扣除。
　　
　　企业发生的存货盘盈，应当计入当期损益，增加当期应纳税所得额。
　　
　　财务处理：
　　
　　企业发生的存货盘亏和毁损，应当将处置收入扣除账面价值和相关税费后的金额计入当期损益。同样，存货发生的盘盈，也应当计入当期损益。会计处理如下：
　　
　　企业进行存货清查盘点，应当编制“存货盘存报告单”，并将其作为存货清查的原始凭证。经过存货盘存记录的实存数与存货的账面记录核对，若账面存货小于实际存货，为存货的盘盈；反之，为存货的盘亏。对于盘盈、盘亏的存货要记入“待处理财产损溢”科目，查明原因进行处理。
　　
　　（一）存货的盘盈
　　
　　企业在财产清查中盘盈的存货，根据“存货盘存报告单”所列金额，编制会计分录如下：
　　
　　借：原材料
　　
　　包装物
　　
　　低值易耗品
　　
　　库存商品等
　　
　　贷：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　盘盈的存货，通常是由企业日常收发计量或计算上的差错所造成的，其盘盈的存货，可冲减管理费用，按规定手续报经批准后，会计分录如下：
　　
　　借：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　贷：管理费用
　　
　　（二）存货的盘亏
　　
　　企业对于盘亏的存货，根据“存货盘存报告单”编制如下会计分录：
　　
　　借：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　贷：原材料
　　
　　包装物
　　
　　低值易耗品
　　
　　库存商品等
　　
　　对于购进的货物、在产品、产成品发生非正常损失引起盘亏存货应负担的增值税，应一并转入“待处理财产损溢”科目。
　　
　　借：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　贷：应交税金——应交增值税（进项税额转出）
　　
　　对于盘亏的存货应根据造成盘亏的原因，分别情况进行转账，属于定额内损耗以及存货日常收发计量上的差错，经批准后转作管理费用.
　　
　　借：管理费用
　　
　　贷：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　对于应由过失人赔偿的损失，应作如下分录：
　　
　　借：其他应收款
　　
　　贷：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　对于自然灾害等不可抗拒的原因而发生的存货损失，应作如下分录：
　　
　　借：营业外支出——非常损失
　　
　　贷：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　对于无法收回的其他损失，经批准后记入“管理费用科目”
　　
　　借：管理费用
　　
　　贷：待处理财产损溢——待处理流动资产损溢
　　
　　企业存货的清查盘点，可分为定期租点和不定期盘点两种，定期盘点一般在月末、季末、年终进行；不定期盘点是指临时性的盘点以及发生事故损失、会计交接、存货调价等而进行的盘点清查。企业应当做好存货的清查工作，加强管理，防止存货的呆滞积压或毁损。