那我要怎么确定给多少个层2 的方程加上残差项呢？

都尝试一下，显著的就保留。

是第二层变量显著的就保留吗？我现在得到的结果文件里面，只要是与第一层变量相关的结果，一个都不显示，然后出现下面这段话，不知道问题又出在哪了？HLM2 is unable to compute starting values based on the specified model.Every level-1 predictor matrix is near singular.
1) Center one or more level-1 predictors.
2) One (or more) of the random effects should be either deleted from the model
   or treated as fixed.

这个提示还是比较清楚的。尝试：将1层变量中心化，2删除二层的某些μ。