其实传统临床研究常采用逐步回归的分析，设定一个纳入模型和剔除模型变量的水平，让模型自己选择标量，并对参数进行估计。也可以将主要的研究变量（蛋白含量）强行放入模型，并逐个将其他研究变量（混杂变量）放入模型，对参数进行估计，并根据评价指标对模型进行评价（the performance for the modelling)，选择最优模型的参数。这只是基于理论的一些原则而已。针对你的问题，有一点需注意，是否吸烟和吸烟指数这两个指标可能有共线性，建议在模型配合时，不要同时放入模型，以免得不到自己期望的结果。但这些只是经验，你也可以将他们同时放入模型，看参数的估计后，再做决定。