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2022-03-07
摘要翻译:
我们讨论了蛋白酶体蛋白质的易位问题,并提出了一个新的蛋白酶体消化(裂解)蛋白质的随机模型。在这个模型中,我们从第一性原理解释了蛋白酶体的蛋白质易位和裂解位点的定位。我们通过实验例子和实验数据的处理表明,我们的模型允许从消化模式的质谱数据重建易位和裂解速率,并可用于研究不同实验装置中的运输性质。对该模型的详细研究将使蛋白酶体活性的理论定量预测成为可能。
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英文标题:
《Reverse Engineering of Proteasomal Translocation Rates》
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作者:
D.S. Goldobin, M. Mishto, K. Textoris-Taube, P.M. Kloetzel, and A.
  Zaikin
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最新提交年份:
2008
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分类信息:

一级分类:Quantitative Biology        数量生物学
二级分类:Other Quantitative Biology        其他定量生物学
分类描述:Work in quantitative biology that does not fit into the other q-bio classifications
不适合其他q-bio分类的定量生物学工作
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一级分类:Quantitative Biology        数量生物学
二级分类:Subcellular Processes        亚细胞过程
分类描述:Assembly and control of subcellular structures (channels, organelles, cytoskeletons, capsules, etc.); molecular motors, transport, subcellular localization; mitosis and meiosis
亚细胞结构(通道、细胞器、细胞骨架、囊膜等)的组装和控制;分子马达;转运;亚细胞定位;有丝分裂和减数分裂
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英文摘要:
  We address the problem of proteasomal protein translocation and introduce a new stochastic model of the proteasomal digestion (cleavage) of proteins. In this model we account for the protein translocation and the positioning of cleavage sites of a proteasome from first principles. We show by test examples and by processing experimental data that our model allows reconstruction of the translocation and cleavage rates from mass spectroscopy data on digestion patterns and can be used to investigate the properties of transport in different experimental set-ups. Detailed investigation with this model will enable theoretical quantitative prediction of the proteasomal activity.
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PDF链接:
https://arxiv.org/pdf/0804.0682
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