小麦栽培种与野生种的转录组组装及差异基因分析
普通六倍体小麦(Triticum aestivum L.)是全世界的主要粮食作物之一,硬粒小麦(Triticum durum)也是西方国家制作通心粉的原材料,国内外对小麦属的进化和驯化研究一直高度重视。小麦属(Triticum)中的一粒、二粒和普通小麦都有野生种和栽培种(或原始栽培种),是研究植物驯化和多倍化难得的材料。
小麦属的驯化对人类历史的发展具有重要的意义,研究小麦属驯化过程中的关键基因,可以使人们深入了解小麦的驯化。本研究对小麦属的乌拉尔图小麦(Triticum urartu)、栽培一粒小麦(Triticum mon ococcum)、野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)、硬粒小麦、斯卑尔脱小麦(Triticum spelta)和中国春6个物种进行转录组测序,通过SNP位点和表达量方面的差异探索小麦的驯化,结果如下:(1)以乌拉尔图小麦为例,评估Trinity无参组装质量。